Gamma estimator of Jarzynski equality for recovering binding energies from noisy dynamic data sets

[Kashalpha]

一言でいうと

単一分子のpulling experimentにおいて、仕事の分布をガンマ分布で仮定することで、Jarzynski等式を使い自由エネルギーの推定を行った論文。

論文リンク

https://www.nature.com/articles/s41467-020-19233-7

概要

Jarzynski等式を使うことで、非平衡な過程でも仕事の分布から自由エネルギーを推定することができる。しかしながら、ナイーブに測定して得られた仕事の分布を使って自由エネルギーを推定すると、必要となるサンプルサイズが大きくなる。そこで、仕事の分布に何らかの仮定を置くことで必要な測定の数を削減することができる。最も単純なのは、仕事の分布を正規分布で近似することであり、これは揺動散逸定理を使うことに等しい。この論文では、正規分布ではなくガンマ分布を利用して自由エネルギーの推定を行っている。

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