diff --git a/figures/Armina.png b/figures/Armina.png new file mode 100644 index 00000000..424bcd56 Binary files /dev/null and b/figures/Armina.png differ diff --git a/figures/GSURCwirehead.png b/figures/GSURCwirehead.png new file mode 100644 index 00000000..a771901a Binary files /dev/null and b/figures/GSURCwirehead.png differ diff --git a/figures/Mateo.png b/figures/Mateo.png new file mode 100644 index 00000000..ed2a1c6d Binary files /dev/null and b/figures/Mateo.png differ diff --git a/figures/Mike.png b/figures/Mike.png new file mode 100644 index 00000000..b1460257 Binary files /dev/null and b/figures/Mike.png differ diff --git a/figures/Pavel.png b/figures/Pavel.png new file mode 100644 index 00000000..86afaaa4 Binary files /dev/null and b/figures/Pavel.png differ diff --git a/figures/Thu.png b/figures/Thu.png new file mode 100644 index 00000000..fd8e95b9 Binary files /dev/null and b/figures/Thu.png differ diff --git a/figures/Usman.png b/figures/Usman.png new file mode 100644 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+superiorinferiorsuperiorinferiorwhitepialcortexodeeulercortexoderk4corticalflowcorticalflow++deepcsrpialnntopofitvox2cortex.07 .22 .37 .52 .67 .82 .97 1.12 1.27 1.42 1.57distance to freesurfer ground truth diff --git a/figures/general_comparison_fin.svg b/figures/general_comparison_fin.svg new file mode 100644 index 00000000..5307392b --- /dev/null +++ b/figures/general_comparison_fin.svg @@ -0,0 +1,27988 @@ + + + + + + + 2023-10-04T20:33:45.438822 + image/svg+xml + + + Matplotlib v3.6.3, https://matplotlib.org/ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 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diff --git a/figures/glacier_arch.svg b/figures/glacier_arch.svg new file mode 100644 index 00000000..7a5a438d --- /dev/null +++ b/figures/glacier_arch.svg @@ -0,0 +1,5691 @@ + + + + diff --git a/figures/meanMLPmodel.svg b/figures/meanMLPmodel.svg new file mode 100644 index 00000000..ceee2dd8 --- /dev/null +++ b/figures/meanMLPmodel.svg @@ -0,0 +1,2953 @@ + + + +Each time point independently traversesthe same MLP with identical weightsLayer normLinear transformLinear transformReLUDropoutMeanSoftmaxx1x2x3x4x5xTxT-1 diff --git a/figures/posterdance.gif b/figures/posterdance.gif new file mode 100644 index 00000000..f59e8e0f Binary files /dev/null and b/figures/posterdance.gif differ diff --git a/figures/self_intersections_scatter.svg b/figures/self_intersections_scatter.svg new file mode 100644 index 00000000..8ba76954 --- /dev/null +++ b/figures/self_intersections_scatter.svg @@ -0,0 +1,5738 @@ + + + + + + + + 2024-02-06T01:13:41.236592 + image/svg+xml + + + Matplotlib v3.5.3, https://matplotlib.org/ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 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