Implémentation de BLIS

1. Installation de BLIS

Installation d'Anaconda :

cd /tmp
url -O https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2019.10-Linux-x86_64.sh
bash Anaconda3-2019.10-Linux-x86_64.sh
source ~/.bashrc

Machines utilisées .... avec ...

git clone https://github.com/flame/blis.git

Installation d'une version plus récente de gcc :

ldconfig -p | grep libpthread
cd ~/blis
sudo apt install build-essential
sudo add-apt-repository ppa:ubuntu-toolchain-r/test
sudo apt-get update
sudo apt-get install gcc-6 g++-6
sudo update-alternatives --install /usr/bin/gcc gcc /usr//bin//gcc-6 20 --slave /usr/bin//g++ g++ /usr/bin/g++-6

Configuration de BLIS

./configure --enable-threading=openmp --enable-cblas  auto
make -j 4
make check
export BLIS_INSTALL_PATH=/usr/local;
sudo make install

2. Installation de numpy adossée à BLIS

Installation de numpy :

git clone https://github.com/numpy/numpy

Changement de la configuration :

cd numpy
cp site.cfg.example site.cfg
nano site.cfg 

Le fichier site.cfg doit être modifié de la manière suivante :

[blis]
libraries = blis
library_dirs = /home/ubuntu/blis/lib/haswell
include_dirs = /home/ubuntu/blis/frame/compat/cblas/src 
runtime_library_dirs = /home/ubuntu/blis/lib/haswell  

Déclarer l'ordre :

export NPY_BLAS_ORDER=blis
export NPY_LAPACK_ORDER='' 

Verification :

python setup.py config 

Installation :

python setup.py install