Este proyecto tiene como objetivo replicar los hallazgos del artículo “Dectin-1 Stimulation by Candida albicans Yeast or Zymosan Triggers NFAT Activation in Macrophages and Dendritic Cells”, utilizando los datos publicados en el repositorio GEO bajo el número de acceso GSE6376.
El estudio original destaca la importancia del receptor de beta-glucano Dectin-1 para el reconocimiento de hongos patogénicos por macrófagos y células dendríticas. Los investigadores demostraron que la señalización de Dectin-1 activa NFAT, modulando la expresión génica y coordinando respuestas antifúngicas. Este proyecto busca identificar genes regulados por la estimulación con Zymosan en Dectin-1 y analizar su significación biológica.
- Replicar los hallazgos del artículo utilizando los datos de GEO.
- Identificar genes regulados por la estimulación con Zymosan en Dectin-1.
- Analizar la significación biológica de los genes regulados en respuesta a Zymosan.
Las muestras utilizadas en este análisis corresponden a macrófagos derivados de la médula ósea con dos condiciones:
• Muestras control (WT): Macrófagos MyD88 -/- sin estimulación. • Muestras estimuladas (TLR): Macrófagos estimulados con Zymosan durante 120 minutos.
El análisis genera visualizaciones como Volcano Plots y Heatmaps para facilitar la interpretación de los genes regulados. Además, se realiza un análisis de enriquecimiento de términos de GO para identificar las funciones biológicas más relevantes.
Los resultados obtenidos en este análisis buscan replicar los hallazgos del artículo original, confirmando la importancia de la señalización de Dectin-1 en la respuesta antifúngica mediada por NFAT. Los genes regulados identificados y el análisis de enriquecimiento biológico proporcionan información valiosa sobre los mecanismos moleculares involucrados.