바이오 케라스 : 케라스와 R을 활용하는 바이오인포메틱스

스터디 정보

저희 모임은 강의식이 아닌 자신이 스스로 공부한 내용을 여러 사람과 공유하는 스터디 방식이며, 스스로 공부하고자 하는 열정을 꼭 준비물로 가지고 와 주시고, 열심히 발표를 해주시면 더욱 감사합니다.

후원사

KossLab : http://devlab.oss.kr/

공유폴더

https://drive.google.com/drive/u/1/folders/1M-KukxONIWpWJD72EyA3a5HQEz27Ldxu

교재 정보

1. R 기초

   • R좀R려줘( 기본기부터 탄탄하게 배우는 R ) : http://www.yes24.com/24/goods/55227627

2. Keras

   • Deep Learning with Keras : http://acornpub.co.kr/book/deep-learning-keras
   • 책 예제 코드 : https://github.com/PacktPublishing/Deep-Learning-with-Keras

3. 생명정보학

   • 생명정보학개론 : https://www.youtube.com/watch?v=08JEruAG8J8&list=PLJiADlvom5cWTvqWvOThaOKstsIWLIBEH ( 40 강좌 )

4. 논문읽기 모임

   • udacity의 Deep Learning : https://www.udacity.com/course/deep-learning--ud730
   • Stanford CS224N(Natural Language Processing with Deep Learning) : https://www.youtube.com/watch?v=OQQ-W_63UgQ&list=PLqdrfNEc5QnuV9RwUAhoJcoQvu4Q46Lja
   • PR12 딥러닝 : https://www.youtube.com/playlist?list=PLlMkM4tgfjnJhhd4wn5aj8fVTYJwIpWkS
   • 딥바이오 논문 : https://github.com/gokceneraslan/awesome-deepbio

차후 스터디

• 의료정보 시스템 : https://www.udacity.com/course/big-data-analytics-in-healthcare--ud758
• MS AI 전문가 과정 ( 무료 ) : https://academy.microsoft.com/en-us/professional-program/tracks/artificial-intelligence/
• 인공지능을 위한 선형대수(주재걸 교수님) : http://www.edwith.org/linearalgebra4ai
• 머신러닝을 위한 python(최성철 교수님) : http://www.edwith.org/aipython
• Bayesian Deep Learning(최성준 박사님) : http://www.edwith.org/bayesiandeeplearning

장소

1. 장소: 신촌 세브란스 연세 암병원 이승호 회의실(B2층) http://goo.gl/sCgerx
   • 지하철 신촌역에서 도보로 이동하시거나 세브란스 버스 정류장에서 하차하세요 (750A, 750B,7024 등 다수)
2. 매주 금요일, 저녁 7시 30분~10시
3. 시작: 2018년 1월 12일

이전 스터디 자료

• 클라우드 바이오 : https://github.com/biospin/cloudnomad_bio
• 모두의 바이오 : https://github.com/biospin/all_bio
• 알바이오플러스 : https://github.com/biospin/R_Bio_Plus
• 알바이오 : https://github.com/biospin/R_Bio
• 빅바이오 : https://github.com/biospin/BigBio
• 딥바이오 : https://github.com/biospin/DeepBio

자매 스터디

• https://www.facebook.com/events/383457538771410/

Schedule

Part 1.

seq.	날짜	내용
1	2018. 1.12	(R 기초) 저자 특강 01(김승욱)
		(생명정보학) 생명정보개론 제1강(조은해)
		(논문읽기 모임) Generative Adversarial Nets(지용기)
2	2018. 1.19	(R 기초) GAN 특강 (김태흥)
		(생명정보학) 생명정보개론 제2강(조은해)
		(논문읽기 모임) udacity의 Deep Learning 1강 :From Machine Learning to Deep Learning(홍정우)
3	2018. 1.26	(Keras) 1장. 신경망 기초(오세진)
		실습 R 코드
		(생명정보학) 생명정보개론 제3강(조은해)
		(논문읽기 모임) udacity의 Deep Learning 2강 : Assignment: notMNIST(홍정우)
4	2018. 2. 2	(R 기초) 2장. 무작정 따라 하는 실습(지용기)
		(생명정보학) 생명정보개론 제4강
		(논문읽기 모임) udacity의 Deep Learning 3강 : Deep Neural Networks

Part 2.

seq.	날짜	내용
1	2018. 2. 9	(Keras) 2장. 케라스 설치와 API
		(생명정보학) 생명정보개론 제5강
		(논문읽기 모임) udacity의 Deep Learning 4강 : Convolutional Neural Networks
2	2018. 2.23	(R 기초) 3장.R아보기
		(생명정보학) 생명정보개론 제6강(박혜진)
		(논문읽기 모임) udacity의 Deep Learning 5강 : Deep Models for Text and Sequences
3	2018. 3. 2	(Keras) 3장. 합성곱 신경망을 활용한 딥러닝
		(생명정보학) 생명정보개론 제7강
		(논문읽기 모임) PR-022: InfoGAN
4	2018. 3. 9	(R 기초) 4장.데이터 이해하기
		(생명정보학) 생명정보개론 제8강
		(논문읽기 모임) PR-040: WaveNet - A Generative Model for Raw Audio(지용기)

Part 3.

seq.	날짜	내용
1	2018. 3.16	(Keras) 4장. 적대적 생성 네트워크와 웨이브넷
		https://raw.githubusercontent.com/bstriner/keras-adversarial/master/examples/image_utils.py
		(생명정보학) 생명정보개론 제9강
		(논문읽기 모임) PR-027:GloVe - Global vectors for word representation
2	2018. 3.23	(R 기초) 5장.데이터 다루기
		(생명정보학) 생명정보개론 제10강
		(논문읽기 모임) Stanford CS224N : Lecture 1
3	2018. 3.30	(Keras) 5장. 단어 임베딩
		(생명정보학) 생명정보개론 제11강
		(논문읽기 모임) Stanford CS224N : Lecture 2
4	2018. 4. 6	(R 기초) 6장.시각화
		(생명정보학) 생명정보개론 제12강
		(논문읽기 모임) Stanford CS224N : Lecture 3

Part 4.

seq.	날짜	내용
1	2018. 4.13	(Keras) 6장. 순환 신경망
		(생명정보학) 생명정보개론 제13강
		(논문읽기 모임) PR-042: Adam: A Method for Stochastic Optimization
2	2018. 4.20	(Keras) 분산케라스
		(생명정보학) 생명정보개론 제14강
		(논문읽기 모임) PR-034: Inception and Xception
3	2018. 4.27	(Keras) 7장. 기타 딥러닝 모델
		(생명정보학) 생명정보개론 제15강
		(논문읽기 모임) PR-005: Playing Atari with Deep Reinforcement Learning
4	2018. 5. 4	(Keras) 8장. AI 게임 플레이
		(논문읽기 모임) 발표자가 선정
		(논문읽기 모임) 발표자가 선정