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oacis_docker ウィキへようこそ!

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目次

• はじめに
• ssh鍵
• ジョブ実行
• ソフトの追加インストール

はじめに

OACISは多数のシミュレーションジョブを実行管理できる便利なソフトです．しかし，Microsoft WindowsユーザやLinuxに不慣れなユーザにとって，OACISをインストールすることは容易ではありません．oacis_dockerは，インストーラビリティの向上を目的に，OACISの一部として開発されています．

ssh鍵

• OACISはジョブ実行ホストにsshログインする必要があります。
• コンテナ内にssh鍵を設置する方法は以下の2通り

  1. 既存の秘密鍵をコンテナにコピー

     • docker cpコマンドでコンテナに秘密鍵をコピーし、docker execコマンドでログイン後、秘密鍵のファイルパーミッションを変更

       docker cp ~/.ssh/id_rsa oacis:/home/oacis/.ssh/id_rsa_remote
       docker exec oacis bash -c "chmod 600 /home/oacis/.ssh/id_rsa_remote"
       docker exec oacis bash -c "chown oacis:oacis /home/oacis/.ssh/id_rsa_remote"

  2. コンテナ内の公開鍵を取得

     • docker cpコマンドでコンテナから公開鍵をコピー

       docker cp oaics:/home/oacis/.ssh/id_rsa.pub .
       #You can find id_rsa.pub

     • 公開鍵をリモートホストに登録

ジョブ実行

• Host登録

  1. リモートホストの登録
     • 特別な設定は不要
  2. ローカルホストの登録

     • コンテナ起動時に，localhostが登録される

     • localhost は仮想マシンのローカルアドレスであり，ホストマシンのlocalhostとは区別される

     • localhost は以下のフィールドを持つ

       Name=localhost
       Hostname=localhost
       Status=enabled
       User=oacis
       Port=22
       SSH\ key=~/.ssh/id_rsa
       Work base directory=~/oacis/public/Result_development/work/__work__
       Mounted work base directory=~/oacis/public/Result_development/work/__work__
       Maximum number of jobs=1
       Polling interval=5
       MPI procs=1
       OMP threads=1

• Simulator登録、ParameterSet作成、Run作成、Analyzer登録、Analysis作成

  1. Webブラウザからの操作

     • 特別な設定は必要ありません。

  2. oacis_cliの利用

     • docker execコマンドでログイン後oacis_cliコマンドを実行する。

       docker exec -it -u oacis oacis bash -l
       cd ~/oacis
       ./bin/oacis_cli usage

ソフトの追加インストール

• ソフトを追加でインストール

  • 例: gnuplotをインストール

    docker exec -it oacis bash
    apt-get update && apt-get install -y gnuplot && apt-get clean