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FPrak Physik Marburg: Maschinelles Lernen in der wissenschaftlichen Bildanalyse
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erjel/F-Prak-SoSe-V15
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Vorbereitungen @Betreuer: Eignene Benutzer fr jede Gruppe anlegen: $ sudo adduser <username> Passwort: **** Benutzer Docker Nutzung erlauben $ sudo usermod -aG docker <username> Ordner vorbereiten mkdir Notebooks mkdir Data @Daten von HDD auf SSD kopieren, damit Batch schnell erstellt wird: cp -r /DATA/F-Praktikum/Data/* /home/<username>/Data* Mit Account auf GPU-Server einloggen und Docker Container starten: $ screen $ docker run --runtime=nvidia --rm --name ${USER}_jupyter_tensorflow -u $(id -u):$(id -g) -v /home/fprak/Data:/DATA -v ${HOME}/Notebooks:/tf/F_Praktikum -it tensorflow/tensorflow:1.13.1-gpu-py3-jupyter (Wenn die letzte Version ausprobieren mchte: tensorflow/tensorflow:latest-gpu-py3-jupyter) Ctrl-a c Information: Token unbedingt aufschreiben, wenn nicht geschehen: Ctrl-a c docker exec -it -u $(id -u):$(id -g) ${USER}_jupyter_tensorflow /bin/bash jupyter notebook list exit exit Optional: Tensorboard starten $ docker exec -it -u $(id -u):$(id -g) ${USER}_jupyter_tensorflow /bin/bash $ tensorboard --logdir tensorboard --logdir /tf/F_Praktikum/logs Ctrl-a c Die IP Adresse des Containers herausfinden und aufschreiben! $ docker inspect ${USER}_jupyter_tensorflow | grep IPAddress $ docker exec -it -u 0 ${USER}_jupyter_tensorflow /bin/bash $ apt update $ apt install libpng12-dev libtiff-dev libwebp-dev xcftools $ pip install --upgrade pip $ pip install imread scipy tables pyevtk scikit-image Oder als Einzeiler; apt update && apt install -y libpng12-dev libtiff-dev libwebp-dev xcftools && pip install --upgrade pip && pip install imread==0.7.0 scipy==1.2.1 tables==3.4.4 pyevtk==1.1.1 scikit-image==0.14.2 auf Studierendencomputer (Putty muss installiert sein!): plink.exe <username>@<GPU Server IP> -N -L 6006:<Docker Container IP>:6006 -L 8888:<Docker Container IP>:8888
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