MSc záróvizsga kidolgozás orvosi mérnökinformatika szakirányra

Mozilla Firefoxban a PDF-ekre mutató külső hivatkozások az adott oldalszámhoz ugranak egyből.

A kidolgozáshoz főleg saját jegyzeteimet, illetve az oktatók jegyzeteit használtam fel.

Felhőszámítási rendszerek:

• freecodecamp - openstack

1. Felhőszámítási rendszerek alapjai: definíciók, szolgáltatási és kialakítási modellek, felhasználási mintázatok

• https://github.com/gabboraron/Felho_alapu_IoT_es_Big_Data_platformok#ea1---big-data-and-hadoop-basics

2. Felhőszámítási rendszerek alapjai: előnyök (felhasználói és szolgáltatói oldalról), technikai, üzleti és emberi tényezők

3. OpenStack felhő: architektúra és alapvető működési mechanizmusok

4. OpenStack Keystone: biztonsági jellemzők, alapkoncepciók és mechanizmusok

5. OpenStack Nova és Glance: virtuális gépekre vonatkozó jellemzők, alapkoncepciók és mechanizmusok

6. OpenStack Neutron: hálózati jellemzők, alapkoncepciók és mechanizmusok

7. OpenStack Cinder és Swift: tárolási jellemzők, alapkoncepciók és mechanizmusok

8. AWS IaaS megoldások (EC2 & tárolási szolgáltatások): jellemzők, alapkoncepciók és mechanizmusok (kifejezetten virtuális gépek menedzsmentjére vonatkozóan)

9. Magas rendelkezésre állás, terheléselosztás és automatikus skálázás az AWS-ben

10. Microsoft Azure / PaaS megoldások: jellemzők, alapkoncepciók és mechanizmusok (adatbázisok)

Diagnosztikai célú orvosi képalkotás

I. Röntgen

1. A röntgen alapú képalkotás
2. A röntgen vizsgálat előnyei, hátrányai
3. Röntgen alapú vizsgálati megoldások
4. A röntgen berendezés általános belső működése
5. A röntgen alapú képalkotás problémái

II. CT - Computer Tomography

1. A CT alapú képalkotás
2. A CT vizsgálat előnyei, hátrányai, backprojection
3. A CT alapú vizsgálati megoldások
4. A CT berendezés általános belső működése
5. A CT fejlődésének főbb állomásai, a CT alapú képalkotás problémái

III. OCT - Optical Coherence Tomography

1. Az OCT alapú képalkotás (TD-OCT, és SD-OCT)
2. Az OCT vizsgálat előnyei, hátrányai
3. Az OCT alapú vizsgálati megoldások
4. Az OCT berendezés általános belső működése
5. Az OCT fejlődésének főbb állomásai, az OCT alapú képalkotás problémái

IV.MRI - Magnetic Resonance Imaging

1. A MRI alapú képalkotás
2. A MRI vizsgálat előnyei, hátrányai
3. A MRI alapú vizsgálati megoldások
4. A MRI berendezés általános belső működése
5. A MRI fejlődésének főbb állomásai, az MRI alapú képalkotás problémái

V. PET - PET Positron Emission Tomography

1. A PET alapú képalkotás
2. A PET vizsgálat előnyei, hátrányai
3. A PET alapú vizsgálati megoldások
4. A PET berendezés általános belső működése
5. A PET fejlődésének főbb állomásai, a PET alapú képalkotás problémái

VI. Spektroszkópia/spektrometria

1. A spektroszkópia/spektrometria alapjai
2. A spektroszkópia/spektrometria előnyei
3. A spektroszkópia/spektrometria hátrányai
4. Spektroszkópia/spektrometria vizsgálati megoldások
5. A spektroszkóp/spektrométer berendezések általános belső működése

VII. CTI - Computerised Thermal Imaging

1. A CTI alapú képalkotás
2. A CTI vizsgálat előnyei, hátrányai
3. A CTI alapú vizsgálatok típusai
4. A főbb hőkamera típusok/általános belső működésük - https://youtu.be/1RTpDI00_9E?t=424
5. A CTI alapú képalkotás problémái

VIII. NIRS - Near-infrared Spectroscopy

1. A NIRS alapú képalkotás
2. A NIRS vizsgálat előnyei, hátrányai
3. A NIRS alapú vizsgálatok típusai
4. A NIRS berendezések általános belső működése
5. A NIRS problémái

IX. Képalkotás optikai tartományban

1. Lencsék tulajdonságai (szférikus, aszférikus, chromat/achromat)
2. Felbontás és számolása, numerikus apertúra
3. Aberrációk a mikroszkópiában
4. Kamerák jellemzői és típusai
5. Nagyítás és számolása, fénytörés, látómező, mélységélesség, munkatávolság

X. Nagyfelbontású (fény)mikroszkópia I.

1. Airy minta
2. Modulációs átviteli függvény (MTF)
3. A mikroszkópok főbb fajtái és jellemzőik
4. Az átmenőfényes mikroszkóp részei, elrendezése, működése
5. Az átmenőfényes mikroszkóp jellemzői, előnyei/hátrányai

XI. Nagyfelbontású (fény)mikroszkópia II.

1. Huygens-Fresnel elv
2. A fluoreszcens mikroszkóp részei, elrendezése, működése
3. Az fluoreszcens mikroszkóp jellemzői, előnyei/hátrányai
4. A sötétlátóteres (darkfield) mikroszkóp részei, elrendezése, működése
5. A sötétlátóteres (darkfield) mikroszkóp jellemzői, előnyei/hátrányai

XII. Digitális mikroszkópia

1. A digitális mikroszkópia előnyei
2. Szuperrezolúció elve, működése, előnyei/hátrányai
3. A tárgylemez scanner felépítése, működése, előnyei/hátrányai
4. Szkennelési típusok
5. Mintavétel képek esetében (Nyquist)

biomikroszkópia tananyagok angolul: https://www.ibiology.org/online-biology-courses/microscopy-series/

XIII. Ultrahangos képalkotás

1. Az ultrahang berendezés részei, elrendezése, működése
2. Az ultrahangos vizsgálat jellemzői, előnyei/hátrányai
3. Az ultrahangos képalkotás: A-mód, B-mód, M-mód, Doppler technikák
4. Az ultrahangos képalkotás: 3D 4D, 3D leképezés/renderelési módok,
5. Felületi képrekonstrukciók és ábrázolási módok, VCI, VOCAL

Biostatisztika

• más jegyzetek a témában:
  • Debreceni egyetem:
    • eredeti: https://kodi.unideb.hu/sites/default/files/upload_documents/biostatsztikajegyzet.pdf
    • fork $_{(2023 január)}$ : https://github.com/gabboraron/msc_zarovizsga-orvosi_mernokinformatika/blob/main/biostatsztikajegyzet.pdf
  • Szegedi egyetem ('18-'19) :
    • eredeti: http://eta.bibl.u-szeged.hu/1782/1/biostat_slides.pdf
    • fork $_{(2023 január)}$ : https://github.com/gabboraron/msc_zarovizsga-orvosi_mernokinformatika/blob/main/biostat_slides-SZTE.pdf
  • biostatisztika nem statisztikusoknak
• egy lapon

1. A biostatisztika áttekintése: kérdésfeltevések és alapproblémák

Tipikus problémák a biostatisztikában, a matematikailag megalapozott módszerek szükségessége az orvosbiológiai kutatások támogatásában. A humán empirikus orvosi kutatások módszerei, kísérlet és megfigyelés. A confounding fogalma. Védekezési lehetőségek a confounding ellen.

2. Az orvosi kutatások vizsgálati módszerei

A vizsgálati módszerek csoportosítása. Megfigyeléses vizsgálatok: egyedi adatok alapuló vizsgálatok (kohorsz, eset-kontroll), aggregált adatokon alapuló (ecological) vizsgálatok, kontroll nélküli vizsgálatok. Kísérletes vizsgálatok jellemzői. Metaanalízisek fogalma, szerepe, fontossága.

3. Deskriptív statisztika: kategoriális változó(k) vizsgálata

Analitikus módszerek kategoriális változó vizsgálatára: gyakorisági sor, gyakoriság, relatív gyakoriság, módusz. Grafikus módszer kategoriális változó vizsgálatára: oszlop- és kördiagram. Két kategoriális változó egyidejű vizsgálata, kereszttábla.

• https://e-akademia.hu/html/zold12/ch-statalap.html#ch:leiro-es-induktiv

4. Deskriptív statisztika: folytonos változó(k) vizsgálata

Analitikus módszerek folytonos változó vizsgálatára: átlag, medián, terjedelem, szórás, IQR, kvantilisek. Grafikus módszer folytonos változó vizsgálatára: hisztogram, magfüggvényes sűrűségbecslés, Tukey-féle boxplot. Két folytonos változó együttes vizsgálata: kovariancia, korreláció, szóródási diagram.

5. Következtető statisztitika alapjai

Minta és sokaság, a mintavételes helyzet fogalma. Véges és fiktív (végtelen) sokaságok. Mintavételi ingadozás és mintavételi hiba, szerepük az orvosi kutatásokban. A mintavételi hiba elleni védekezés alapgondolatai. Mintavételi és nem-mintavételi hiba.

6. A következtető statisztika apparátusa: becsléselmélet

A becsléselmélet alapjai: becslőfüggvény, a becslőfüggvény mintavételi tulajdonságai (torzítatlanság, hatásosság, konzisztencia stb.). Pontbecslés és intervallumbecslés (konfidenciaintervallum). A mintanagyság szerepe és jelentősége, mintanagyság-tervezés.

7. A következtető statisztika apparátusa: hipotézisvizsgálat

A hipotézisvizsgálat alapfogalmai, null- és ellenhipotézis, tesztstatisztika. A hipotézisvizsgálat logikája. Első- és másodfajú hiba. Döntés hipotézisvizsgálatban: szignifikanciaszint, kritikus érték, p-érték. Egy- és kétoldalú próbák. Próba választása adott kérdés vizsgálatára.