data_prepare.sh
数据的原始准备,为Gmatrix.R文件提供读入文件ID.txt和pop.raw
Gmatrix.R
该文件为构建基因组选择矩阵的R脚本,通过读入ID.txt和pop.raw进行矩阵计算,输出文件为Ginv.csv
gblup.R
该文件的输入文件分别为Ginv.csv、ID.txt、pheno.txt(该文件为生产数据),并且需要导入rntransform.R、ztransform.R文件进行数据正态转化,最终经过计算得到的文件分别为trait_var.txt、trait_h2.txt、GEBV_trait.csv
multiple_trait.sh
该文件的目的是为了传参数到gblup.R文件里,通过替换{trait} 完成多个性状的计算,并且利用shell脚本实现并行计算