Skip to content

zhangwenda0518/my_script_for_record

Folders and files

NameName
Last commit message
Last commit date

Latest commit

 

History

12 Commits
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

Repository files navigation

my_script_for_record

some scripts for myself ! any question issue me!

有朋自远方来,不亦乐乎!

WeChat:15651721689

#GFAP-linux2.py 使用

GFAP 是一款新的植物基因功能注释的软件,我常用于KEGG和GO的分析工作。

但是原脚本限制只能在程序的目录进行使用,当我进行多个基因组的注释时,会遇到很多问题。因此,我尝试进行了代码的补充。

1.可以在任意工作目录使用

2.可以指定输出文件目录

3.运行日志,进行了存放,以保持页面整洁。

示例:

python3 ~/biosoft/GFAP-linux/GFAP-linux2.py -go -pfam -kegg -awd nr -cpu 20 -qp test.fa -o gfap-nr

About

No description, website, or topics provided.

Resources

Stars

Watchers

Forks

Releases

No releases published

Packages

No packages published