some scripts for myself ! any question issue me!
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#GFAP-linux2.py 使用
GFAP 是一款新的植物基因功能注释的软件,我常用于KEGG和GO的分析工作。
但是原脚本限制只能在程序的目录进行使用,当我进行多个基因组的注释时,会遇到很多问题。因此,我尝试进行了代码的补充。
1.可以在任意工作目录使用
2.可以指定输出文件目录
3.运行日志,进行了存放,以保持页面整洁。
示例:
python3 ~/biosoft/GFAP-linux/GFAP-linux2.py -go -pfam -kegg -awd nr -cpu 20 -qp test.fa -o gfap-nr