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@GuangchuangYu
GuangchuangYu committed Aug 20, 2024
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<link>http://yulab-smu.top/news/</link>
<pubDate>Mon, 01 Jan 0001 00:00:00 +0000</pubDate>
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<description>Aug 2024: tigeR包发表在iMeta期刊，恭喜陈逸豪（2019级生信本科，协和研一）。&#xA;Aug 2024: 综述文章：Bioinformatics Software Development: principles and future directions，在The Innovation Life发表。&#xA;Aug 2024: 综述文章：Computational modeling for medical data: from data collection to knowledge discovery，在The Innovation Life发表，恭喜徐双斌。&#xA;The Innovation官方公众号报道文章 Jul 2024: fanyi包在Chinese Medical Journal发表，恭喜王荻霏（临床医学本科生）。&#xA;中华医学期刊官方公众号报道文章 Jul 2024: clusterProfiler在Nature Protocols发表，恭喜徐双斌、谢子敬和罗晓。&#xA;入选为Nature Protocols期刊的Feature Protocol 受邀在Springer Nature Research Communities的“Behind the Paper”栏目分享该论文的研究经历 南方医科大学基础医学院网站及公众号报道文章 Jul 2024: 余光创受邀请在香港大学Croucher Summer Course: Virus evolution and epidemiology讲授ggtree。&#xA;Jul 2024: 2024年前沿创新大会，颁发多个奖项，余光创获得Best Reviewer奖项，团队文章荣获Best Paper, Most Read, Most Download三个奖项。&#xA;Jun 2024: 余光创获得2024年广东省研究生教育创新计划项目资助（项目批准号：2024SFKC_019）；立项类型：研究生示范课程；项目名称：生物信息学。</description>
<description>Aug 2024: tigeR包发表在iMeta期刊，恭喜陈逸豪（2019级生信本科，协和研一）。&#xA;Aug 2024: 综述文章：Bioinformatics Software Development: principles and future directions，在The Innovation Life发表。&#xA;Aug 2024: 综述文章：Computational modeling for medical data: from data collection to knowledge discovery，在The Innovation Life发表，恭喜徐双斌。&#xA;The Innovation官方公众号报道文章 Jul 2024: fanyi包在Chinese Medical Journal发表，恭喜王荻霏（临床医学本科生）。&#xA;中华医学期刊官方公众号报道文章 Jul 2024: clusterProfiler在Nature Protocols发表，恭喜徐双斌、谢子敬和罗晓。&#xA;入选为Nature Protocols期刊的Feature Protocol 受邀在Springer Nature Research Communities的“Behind the Paper”栏目分享该论文的研究经历 南方医科大学基础医学院网站及公众号报道文章 热心肠研究院报道 Jul 2024: 余光创受邀请在香港大学Croucher Summer Course: Virus evolution and epidemiology讲授ggtree。&#xA;Jul 2024: 2024年前沿创新大会，颁发多个奖项，余光创获得Best Reviewer奖项，团队文章荣获Best Paper, Most Read, Most Download三个奖项。</description>
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<title>Projects</title>
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Aug 2024: 综述文章：Computational modeling for medical data: from data collection to knowledge discovery，在The Innovation Life发表，恭喜徐双斌。
The Innovation官方公众号报道文章 Jul 2024: fanyi包在Chinese Medical Journal发表，恭喜王荻霏（临床医学本科生）。
中华医学期刊官方公众号报道文章 Jul 2024: clusterProfiler在Nature Protocols发表，恭喜徐双斌、谢子敬和罗晓。
入选为Nature Protocols期刊的Feature Protocol 受邀在Springer Nature Research Communities的“Behind the Paper”栏目分享该论文的研究经历 南方医科大学基础医学院网站及公众号报道文章 Jul 2024: 余光创受邀请在香港大学Croucher Summer Course: Virus evolution and epidemiology讲授ggtree。
Jul 2024: 2024年前沿创新大会，颁发多个奖项，余光创获得Best Reviewer奖项，团队文章荣获Best Paper, Most Read, Most Download三个奖项。
Jun 2024: 余光创获得2024年广东省研究生教育创新计划项目资助（项目批准号：2024SFKC_019）；立项类型：研究生示范课程；项目名称：生物信息学。">
入选为Nature Protocols期刊的Feature Protocol 受邀在Springer Nature Research Communities的“Behind the Paper”栏目分享该论文的研究经历 南方医科大学基础医学院网站及公众号报道文章 热心肠研究院报道 Jul 2024: 余光创受邀请在香港大学Croucher Summer Course: Virus evolution and epidemiology讲授ggtree。
Jul 2024: 2024年前沿创新大会，颁发多个奖项，余光创获得Best Reviewer奖项，团队文章荣获Best Paper, Most Read, Most Download三个奖项。">
<meta name="keywords" content="developer,bioinformatics,omics,visualization">


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Aug 2024: 综述文章：Computational modeling for medical data: from data collection to knowledge discovery，在The Innovation Life发表，恭喜徐双斌。
The Innovation官方公众号报道文章 Jul 2024: fanyi包在Chinese Medical Journal发表，恭喜王荻霏（临床医学本科生）。
中华医学期刊官方公众号报道文章 Jul 2024: clusterProfiler在Nature Protocols发表，恭喜徐双斌、谢子敬和罗晓。
入选为Nature Protocols期刊的Feature Protocol 受邀在Springer Nature Research Communities的“Behind the Paper”栏目分享该论文的研究经历 南方医科大学基础医学院网站及公众号报道文章 Jul 2024: 余光创受邀请在香港大学Croucher Summer Course: Virus evolution and epidemiology讲授ggtree。
Jul 2024: 2024年前沿创新大会，颁发多个奖项，余光创获得Best Reviewer奖项，团队文章荣获Best Paper, Most Read, Most Download三个奖项。
Jun 2024: 余光创获得2024年广东省研究生教育创新计划项目资助（项目批准号：2024SFKC_019）；立项类型：研究生示范课程；项目名称：生物信息学。">
入选为Nature Protocols期刊的Feature Protocol 受邀在Springer Nature Research Communities的“Behind the Paper”栏目分享该论文的研究经历 南方医科大学基础医学院网站及公众号报道文章 热心肠研究院报道 Jul 2024: 余光创受邀请在香港大学Croucher Summer Course: Virus evolution and epidemiology讲授ggtree。
Jul 2024: 2024年前沿创新大会，颁发多个奖项，余光创获得Best Reviewer奖项，团队文章荣获Best Paper, Most Read, Most Download三个奖项。">

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Aug 2024: 综述文章：Computational modeling for medical data: from data collection to knowledge discovery，在The Innovation Life发表，恭喜徐双斌。
The Innovation官方公众号报道文章 Jul 2024: fanyi包在Chinese Medical Journal发表，恭喜王荻霏（临床医学本科生）。
中华医学期刊官方公众号报道文章 Jul 2024: clusterProfiler在Nature Protocols发表，恭喜徐双斌、谢子敬和罗晓。
入选为Nature Protocols期刊的Feature Protocol 受邀在Springer Nature Research Communities的“Behind the Paper”栏目分享该论文的研究经历 南方医科大学基础医学院网站及公众号报道文章 Jul 2024: 余光创受邀请在香港大学Croucher Summer Course: Virus evolution and epidemiology讲授ggtree。
Jul 2024: 2024年前沿创新大会，颁发多个奖项，余光创获得Best Reviewer奖项，团队文章荣获Best Paper, Most Read, Most Download三个奖项。
Jun 2024: 余光创获得2024年广东省研究生教育创新计划项目资助（项目批准号：2024SFKC_019）；立项类型：研究生示范课程；项目名称：生物信息学。">
入选为Nature Protocols期刊的Feature Protocol 受邀在Springer Nature Research Communities的“Behind the Paper”栏目分享该论文的研究经历 南方医科大学基础医学院网站及公众号报道文章 热心肠研究院报道 Jul 2024: 余光创受邀请在香港大学Croucher Summer Course: Virus evolution and epidemiology讲授ggtree。
Jul 2024: 2024年前沿创新大会，颁发多个奖项，余光创获得Best Reviewer奖项，团队文章荣获Best Paper, Most Read, Most Download三个奖项。">
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Expand Down Expand Up @@ -183,6 +180,7 @@ <h1 class="title">
<li>入选为Nature Protocols期刊的<a href="/images/knowledge-mining/featured-protocol-2024.jpeg" >Feature Protocol</a></li>
<li>受邀在Springer Nature Research Communities的“Behind the Paper”栏目分享<a href="https://communities.springernature.com/posts/using-clusterprofiler-to-characterise-multi-omics-data" class="external-link" target="_blank" rel="noopener">该论文的研究经历</a></li>
<li>南方医科大学基础医学院<a href="https://portal.smu.edu.cn/jcyxy/info/1046/6504.htm" class="external-link" target="_blank" rel="noopener">网站</a>及<a href="https://mp.weixin.qq.com/s/UKNAg13ToZdXsy0nEl9lKw" class="external-link" target="_blank" rel="noopener">公众号</a>报道文章</li>
<li><a href="https://www.chinagut.cn/papers/read/267b2c6e8ba64014ae3ce91d6183dbb3" class="external-link" target="_blank" rel="noopener">热心肠研究院报道</a></li>
</ul>
<p><strong><font color="green">Jul 2024</font></strong>: 余光创受邀请在香港大学Croucher Summer Course: <a href="https://projects.croucher.org.hk/summer-courses/virus-evolution-and-epidemiology" class="external-link" target="_blank" rel="noopener">Virus evolution and epidemiology</a>讲授<a href="https://github.com/YuLab-SMU/learnggtree" class="external-link" target="_blank" rel="noopener">ggtree</a>。</p>
<p><strong><font color="green">Jul 2024</font></strong>: <a href="http://www.the-innovation.org.cn/conference" class="external-link" target="_blank" rel="noopener">2024年前沿创新大会</a>，颁发多个奖项，余光创获得Best Reviewer奖项，团队文章荣获Best Paper, Most Read, Most Download三个奖项。</p>
Expand Down Expand Up @@ -292,15 +290,15 @@ <h1 class="title">
<p><strong><font color="green">Oct 2021</font></strong>: 恭喜徐双斌和郭平凡分别获得博士、硕士研究生国家奖学金。</p>
<p><strong><font color="green">Sep 2021</font></strong>: <em>ggtreeExtra</em>包在环形布局上实现了多维数据的整合可视化，发表在<em><strong>Molecular Biology and Evolution</strong></em>期刊 (<a href="https://doi.org/10.1093/molbev/msab166" class="external-link" target="_blank" rel="noopener">link</a>)， 恭喜徐双斌。</p>
<p><strong><font color="green">Sep 2021</font></strong>: 🌹 欢迎李林、谢子敬和谢汶琴加入YuLab。恭喜汶琴获得推免生奖学金。</p>
<p><strong><font color="green">Aug 2021</font></strong>: <em>clusterProfiler</em>发布4.0版本，文章发表于<em><strong>The Innovation</strong></em>期刊 (Links: <a href="https://doi.org/10.1016/j.xinn.2021.100141" class="external-link" target="_blank" rel="noopener">article</a>, <a href="https://mp.weixin.qq.com/s/kVEr9qY0x8Ef3LOX4Wt9FQ" class="external-link" target="_blank" rel="noopener">TheInnovation创新公众号报道</a>)，恭喜吴天志<!-- 和胡二强-->。</p>
<p><strong><font color="green">Aug 2021</font></strong>: <em>clusterProfiler</em>发布4.0版本，文章发表于<em><strong>The Innovation</strong></em>期刊 (Links: <a href="https://doi.org/10.1016/j.xinn.2021.100141" class="external-link" target="_blank" rel="noopener">article</a>, <a href="https://mp.weixin.qq.com/s/kVEr9qY0x8Ef3LOX4Wt9FQ" class="external-link" target="_blank" rel="noopener">TheInnovation创新公众号报道</a>)，恭喜吴天志。</p>
<p><strong><font color="green">Jun 2021</font></strong>: 陈玫君同学参加南方医科大学学生抗疫服务队，支援广州市白云区大规模核酸采样。</p>
<p><strong><font color="green">Jun 2021</font></strong>: 课题组开发的检索新冠疫情的nCov2019包发表在PeerJ期刊上（<a href="https://peerj.com/articles/11421/" class="external-link" target="_blank" rel="noopener">link</a>），恭喜吴天志。</p>
<p><strong><font color="green">May 2021</font></strong>: 课题组公众号“YuLabSMU”入选<a href="https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI5NjUyNzkxMg==&amp;mid=2247490741&amp;idx=1&amp;sn=3e550bdb266608300e92db47ab247931&amp;chksm=ec43adf2db3424e4d0d66907e03e02dd514ea16bdf9bd8bd2c69edb048c79f1b937add2adc61#rd" class="external-link" target="_blank" rel="noopener">2020年度科研团队公众号Top10</a>。</p>
<p><strong><font color="green">Apr 2021</font></strong>: 余光创入选爱思唯尔2020年中国高被引学者（<a href="/images/award/2020-highly-cited-researcher.png" >证书</a>）。</p>
<p><strong><font color="green">Dec 2020</font></strong>: 余光创于2017年发表在<em><strong>Methods in Ecology and Evolution</strong></em>上的<em>ggtree</em>文章，入选MEE期刊创刊十周年10篇<a href="https://methodsblog.com/2020/11/19/ggtree-tree-visualization/" class="external-link" target="_blank" rel="noopener">代表作</a>。</p>
<p><strong><font color="green">Oct 2020</font></strong>: 余光创入选全球前2%顶尖科学家榜单（World’s Top 2% Scientists）中的<a href="https://elsevier.digitalcommonsdata.com/datasets/btchxktzyw/2" class="external-link" target="_blank" rel="noopener">“年度影响力”榜单</a>。</p>
<p><strong><font color="green">Oct 2020</font></strong>: 余光创受邀请在<a href="https://biocasia2020.bioconductor.org/" class="external-link" target="_blank" rel="noopener">Bioconductor亚洲区年会</a>上做专题报告，介绍系统发育数据整合与可视化方面的工作；二年级博士生徐双斌在Workshop环节介绍使用课题组开发的MicrobiotaProcess分析宏基因组数据。</p>
<p><strong><font color="green">Sep 2020</font></strong>: 🌹 欢迎吴天志<!-- 、胡二强-->、唐文丽、陈玫君和詹历加入YuLab。</p>
<p><strong><font color="green">Sep 2020</font></strong>: 🌹 欢迎吴天志、唐文丽、陈玫君和詹历加入YuLab。</p>
<p><strong><font color="green">Mar 2020</font></strong>: 受William Pearson教授的邀请，在<em><strong>Current Protocols in Bioinformatics</strong></em>期刊上发表<em>ggtree</em>文章，通过实例介绍<em>ggtree</em>的使用 (<a href="https://doi.org/10.1002/cpbi.96" class="external-link" target="_blank" rel="noopener">link</a>)</p>
<p><strong><font color="green">Feb 2020</font></strong>: <em>treeio</em>包解决系统发育树及相关数据的输入与输出问题，成果发表在<em><strong>Molecular Biology and Evolution</strong></em>期刊 (<a href="https://doi.org/10.1093/molbev/msz240" class="external-link" target="_blank" rel="noopener">link</a>)。</p>
<p><strong><font color="green">Jan 2020</font></strong>: 《Stem Cell Transcriptional Networks》第二版出版，余光创撰写了其中的第十一章《Gene Ontology Semantic Similarity Analysis Using GOSemSim》(<a href="http://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-0301-7_11" class="external-link" target="_blank" rel="noopener">link</a>)。</p>
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